GD1611Cy型蓝藻在线检测仪，通过荧光法可快速、自动、原位测量蓝藻。其原理是：蓝藻的主导光合色素为叶绿素a和藻蓝蛋白。藻蓝蛋白是淡水蓝藻所特有的色素，有很强的荧光特性并且不干扰叶绿素的荧光。研究发现藻蓝蛋白可以从其他藻类干扰中被检测到。可通过检测藻蓝蛋白荧光强度快速检测蓝藻生物量。仪器使用中无需试剂，具有灵敏度高、速度快、实时性好的优点。